O retículo endoplasmático rugoso e o Complexo de Golgi apresentam uma importante relação morfofuncional. As vesículas que saem do retículo endoplasmático rugoso seguem para o Complexo de Golgi, onde ocorrem várias atividades no conteúdo dessas vesículas. Se as vesículas do retículo chegam ao golgi, e as proteínas que estão em seu interior apresentam problemas em sua produção: