Uma técnica muito utilizada na avaliação da interação entre o ligante e um alvo molecular de estrutura
conhecida é a técnica de ancoramento molecular. Sobre esta importante técnica, assinale a alternativa
incorreta:
O redocking molecular é uma variação da técnica que permite validar um protocolo de docagem por
meio da reavaliação do ancoramento de um ligante cocristalizado experimentalmente comparando a
pose experimental com a pose in silico, em que quanto maior o valor de RMSD entre elas mais
próximo do experimental é o protocolo de docagem.
A docagem molecular avalia a interação entre a pose de menor energia do ligante com residuos de
aminoácidos presentes na cavidade do sitio catalítico do alvo molecular.
O ancoramento molecular é uma técnica rápida e de baixo custo computacional que permite o
entendimento sobre o modo de interação entre um ligante avaliado e o alvo molecular.
O docking molecular trabalha com métodos estocásticos como Monte Carlo e algoritmo genético que
visam avaliar as poses de menor energia do ligante na cavidade do alvo, determinando a melhor
conformação e configuração que responderá pela melhor pontuação de interação.
Uma grande limitação sobre a técnica de ancoramento molecular é o fato de ela não considerar
influências da interação ligante-alvo sobre a estrutura de ambos, considerando a estrutura do alvo
como rigida ou semi-rigida, o que afasta do modelo preferencialmente aceito do encaixe induzido.
