·
Agronomia ·
Genética
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Genes Ligados e teste de significância Dois genes mesmo cromossomo AGR 213 Genética Os genes são considerados ligados quando genes que determinam diferentes características estão situados no mesmo par de homólogos Verificação Os genes estão no mesmo par de homólogos ou em cromossomos diferentes A resposta depende dos tipos e proporções dos gametas do heterozigoto Genes Ligados Cis ABab Trans AbaB Individuo Tipo de gametas produzidos 1ª conclusão tipo de herança 2ª conclusão localização dos genes nos cromossomos AaBb 14 AB 14 Ab 14 aB 14 ab Segregação independente ou seja obedece à segunda lei de Mendel Dois pares de genes em cromossomos diferentes CcDd 12 CD 12 cd Ligação ou linkage total não se verificando aqui a segunda lei de Mendel Dois pares de genes no mesmo par cromossômico EeFf 40 EF 10 Ef 10 eF 40 ef Ligação ou linkage em que ocorreu crossingover aqui também não se verificou a segunda lei de Mendel Dois pares de genes no mesmo par cromossômico Quiasma 1ª divisão 2ª divisão Combinação parental Recombinantes Combinação parental AaBb AB25 Ab25 aB25 ab25 Cromossomos diferentes Genes não estão ligados Obedecem à Segunda Lei de Mendel AaBb AB50 ab50 Mesmo par de homólogos Genes em ligação linkage total Não ocorreu crossingover AaBb AB45 Ab5 aB5 ab45 Mesmo par de homólogos Genes em ligação linkage Ocorreu crossingover quebra o linkage Faça um cruzamento teste cruzar com duplo recessivo e analise os resultados da geração seguinte Isso lhe possibilitará saber se os genes estão ou não ligados Exemplo A asa longa aa asa curta B olho vermelho bb olho branco longa vermelho AABB X curta branco aabb F1 100 asa longa e olho vermelho AaBb COMO SABER SE OS GENES ESTÃO LIGADOS OU OBEDECEM À SEGUNDA LEI DE MENDEL AaBb longa vermelho x aabb curta branco AB Ab aB e ab ab 48 longa vermelho AaBb 48 curta branco aabb 2 longa branco Aabb 2 curta vermelho aaBb Gametas AB e ab 48 cada Ab e aB 2 cada Os Genes a e b estão ligados Genes estão ligados Gametas em maior proporção são chamados de parentais Os de menor proporção são chamados de recombinantes Conclusão A posição e a distância relativa entre os genes Maior distância entre os genes maior a chance de crossingover Convenção 1 de gametas recombinantes equivale a uma unidade de distância entre os genes Ou seja 1 de recombinantes equivale a 1 centimorgan cM A soma das porcentagens dos recombinantes determina a distância relativa entre os genes Exemplo entre Aa e Bb há 4 unidades de distância ou 4 cM Mapas Genéticos TESTE DE SIGNIFICÂNCIA QUI QUADRADO χ ² O teste de χ ² é eficiente para testar hipóteses genéticas pois Leva em consideração os desvios ocorridos entre valores previstos e observados É sensível ao tamanho da amostra NÍVEL DE SIGNIFICÂNCIA PRÉESTABELECIDO Para se testar uma hipótese genética é necessário obter duas estatísticas denominadas χ ² calculado e χ ² tabelado O χ ² calculado é obtido a partir dos dados experimentais levandose em conta os valores observados e aqueles que seriam esperados dentro da hipótese genética formulada O χ ² tabelado depende dos graus de liberdade e do nível de significância adotado A tomada de decisão é feita comparandose o valor do x² obtido com base nos resultados observados com o valor do x² apresentado nas tabelas Se χ ² calc χ ² tab RejeitaseHo Se χ ² calc χ ² tab Não se rejeita Ho H0 referese àhipóteseformulada a respeitodo caráter que se está estudando O valor do χ ² tabelado é encontrado em vários livros de estatística sendo obtido para um determinado nível de significância alfa e certos graus de liberdade O grau de liberdade na maioria das vezes é igual ao número de classes fenotípicas menos 1 O nível de significância alfa representa a máxima probabilidade de erro que se tem ao rejeitar uma hipótese Exemplo Aplicação do teste 2 aos dados da geração F2 relativo ao estudo da herança da cor e textura do grão de milho Hipótese 9331 Fenótipo O E Desvio O E d2 d2E Amarela lisa 268 270 2 Amarela enrugada 86 90 4 Branca lisa 97 90 7 Branca enrugada 29 30 1 Somatório 2 2 E E O ² calculado 268270²270 8690²90 9790²90 2930²30 077 Os graus de liberdade são GL n1 41 3 2calc077 Tabelado 25 gl3782 ² calc ² tab Não se rejeita Ho Ou seja não se rejeita a hipótese de que o caráter segue distribuição fenotípica de 9331 O teste de quiquadrado aplicável às análises de resultados genéticos tem as seguintes vantagens É sensível aos desvios definidos entre valores previstos e observados e ao tamanho da amostra O teste exige que quanto maior for o tamanho da amostra menor sejam os desvios para que não aconteça a rejeição da hipótese Limitações O teste 2 nunca deve ser utilizado em proporções ou em porcentagens O teste 2 não é adequado para experimentos em que a frequência esperada de qualquer classe fenotípica seja menor que cinco Quando o a frequência de qualquer classe estiver situada ente 5 e 10 ou quando há somente 1 grau de liberdade fazse necessário uma correção da fórmula dada por 50 2 2 E E O Exercício Um dado cruzamento gera na prole uma proporção de 210 90 a Quantos graus de liberdade há nesse caso b Calcule o quiquadrado para a hipótese 21 c Calcule o quiquadrado para a hipótese 31 d O desvio é significativo em ambos os casos Qual a provável explicação genética para isso Conclua para a hipótese mais adequada TABELA 78 Valores de χ² para diferentes níveis de probabilidade GL1 Probabilidades 095 090 080 070 050 030 020 010 005 001 0001 1 0004 002 006 015 046 107 164 271 384 664 1083 2 010 021 045 071 139 241 322 460 599 921 1382 3 035 058 101 142 237 366 464 625 782 1134 1627 4 071 106 165 220 336 488 599 778 949 1328 1847 5 114 161 234 300 435 606 729 924 1107 1509 2052 6 163 220 307 383 535 723 856 1064 1259 1681 2246 7 217 283 382 467 635 838 980 1202 1407 1848 2432 8 273 349 459 553 734 952 1103 1336 1551 2009 2612 9 332 417 538 639 834 1066 1224 1468 1692 2167 2788 10 394 486 618 727 934 1178 1344 1599 1831 2321 2959 Não significativo Significativo 1 Grau de Liberdade INSTITUTO FEDERAL Espírito Santo Educação pública gratuita e de qualidade
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Combinação parental Recombinantes Combinação parental AaBb AB25 Ab25 aB25 ab25 Cromossomos diferentes Genes não estão ligados Obedecem à Segunda Lei de Mendel AaBb AB50 ab50 Mesmo par de homólogos Genes em ligação linkage total Não ocorreu crossingover AaBb AB45 Ab5 aB5 ab45 Mesmo par de homólogos Genes em ligação linkage Ocorreu crossingover quebra o linkage Faça um cruzamento teste cruzar com duplo recessivo e analise os resultados da geração seguinte Isso lhe possibilitará saber se os genes estão ou não ligados Exemplo A asa longa aa asa curta B olho vermelho bb olho branco longa vermelho AABB X curta branco aabb F1 100 asa longa e olho vermelho AaBb COMO SABER SE OS GENES ESTÃO LIGADOS OU OBEDECEM À SEGUNDA LEI DE MENDEL AaBb longa vermelho x aabb curta branco AB Ab aB e ab ab 48 longa vermelho AaBb 48 curta branco aabb 2 longa branco Aabb 2 curta vermelho aaBb Gametas AB e ab 48 cada Ab e aB 2 cada Os Genes a e b estão ligados Genes estão ligados Gametas em maior proporção são chamados de parentais Os de menor proporção são chamados de recombinantes Conclusão A posição e a distância relativa entre os genes Maior distância entre os genes maior a chance de crossingover Convenção 1 de gametas recombinantes equivale a uma unidade de distância entre os genes Ou seja 1 de recombinantes equivale a 1 centimorgan cM A soma das porcentagens dos recombinantes determina a distância relativa entre os genes Exemplo entre Aa e Bb há 4 unidades de distância ou 4 cM Mapas Genéticos TESTE DE SIGNIFICÂNCIA QUI QUADRADO χ ² O teste de χ ² é eficiente para testar hipóteses genéticas pois Leva em consideração os desvios ocorridos entre valores previstos e observados É sensível ao tamanho da amostra NÍVEL DE SIGNIFICÂNCIA PRÉESTABELECIDO Para se testar uma hipótese genética é necessário obter duas estatísticas denominadas χ ² calculado e χ ² tabelado O χ ² calculado é obtido a partir dos dados experimentais levandose em conta os valores observados e aqueles que seriam esperados dentro da hipótese genética formulada O χ ² tabelado depende dos graus de liberdade e do nível de significância adotado A tomada de decisão é feita comparandose o valor do x² obtido com base nos resultados observados com o valor do x² apresentado nas tabelas Se χ ² calc χ ² tab RejeitaseHo Se χ ² calc χ ² tab Não se rejeita Ho H0 referese àhipóteseformulada a respeitodo caráter que se está estudando O valor do χ ² tabelado é encontrado em vários livros de estatística sendo obtido para um determinado nível de significância alfa e certos graus de liberdade O grau de liberdade na maioria das vezes é igual ao número de classes fenotípicas menos 1 O nível de significância alfa representa a máxima probabilidade de erro que se tem ao rejeitar uma hipótese Exemplo Aplicação do teste 2 aos dados da geração F2 relativo ao estudo da herança da cor e textura do grão de milho Hipótese 9331 Fenótipo O E Desvio O E d2 d2E Amarela lisa 268 270 2 Amarela enrugada 86 90 4 Branca lisa 97 90 7 Branca enrugada 29 30 1 Somatório 2 2 E E O ² calculado 268270²270 8690²90 9790²90 2930²30 077 Os graus de liberdade são GL n1 41 3 2calc077 Tabelado 25 gl3782 ² calc ² tab Não se rejeita Ho Ou seja não se rejeita a hipótese de que o caráter segue distribuição fenotípica de 9331 O teste de quiquadrado aplicável às análises de resultados genéticos tem as seguintes vantagens É sensível aos desvios definidos entre valores previstos e observados e ao tamanho da amostra O teste exige que quanto maior for o tamanho da amostra menor sejam os desvios para que não aconteça a rejeição da hipótese Limitações O teste 2 nunca deve ser utilizado em proporções ou em porcentagens O teste 2 não é adequado para experimentos em que a frequência esperada de qualquer classe fenotípica seja menor que cinco Quando o a frequência de qualquer classe estiver situada ente 5 e 10 ou quando há somente 1 grau de liberdade fazse necessário uma correção da fórmula dada por 50 2 2 E E O Exercício Um dado cruzamento gera na prole uma proporção de 210 90 a Quantos graus de liberdade há nesse caso b Calcule o quiquadrado para a hipótese 21 c Calcule o quiquadrado para a hipótese 31 d O desvio é significativo em ambos os casos Qual a provável explicação genética para isso Conclua para a hipótese mais adequada TABELA 78 Valores de χ² para diferentes níveis de probabilidade GL1 Probabilidades 095 090 080 070 050 030 020 010 005 001 0001 1 0004 002 006 015 046 107 164 271 384 664 1083 2 010 021 045 071 139 241 322 460 599 921 1382 3 035 058 101 142 237 366 464 625 782 1134 1627 4 071 106 165 220 336 488 599 778 949 1328 1847 5 114 161 234 300 435 606 729 924 1107 1509 2052 6 163 220 307 383 535 723 856 1064 1259 1681 2246 7 217 283 382 467 635 838 980 1202 1407 1848 2432 8 273 349 459 553 734 952 1103 1336 1551 2009 2612 9 332 417 538 639 834 1066 1224 1468 1692 2167 2788 10 394 486 618 727 934 1178 1344 1599 1831 2321 2959 Não significativo Significativo 1 Grau de Liberdade INSTITUTO FEDERAL Espírito Santo 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