Trabalho - Simulando a Seleção Natural e Interações

UNIVERSIDADE DO ESTADO DO RIO DE JANEIRO UERJ INSTITUTO DE BIOLOGIA ROBERTO ALCANTARA GOMES IBRAG DEPARTAMENTO DE GENÉTICA DGEN 2 Observação Nos EUA assim como em outros países de língua inglesa usase geralmente um ponto decimal ao invés de uma vírgula decimal como usada no Brasil 3 Deixando todos os parâmetros em seus valorespadrão p vs t on Fitness on WAA 1 WAa 095 Waa 09 One Initial Frequency on Initial Frequency 01 Generations 130 selecione View Ver 4 Uma nova janela Ouput Saída das simulações aparecerá mostrando um gráfico de dispersão p vs t onde a O eixo da abcissa x corresponde às gerações t Generations de simulação e b O eixo da ordenada y corresponde às frequências alélicas p Allelic Frequency em cada geração 5 Feche a janela Ouput e repita a simulação selecionando agora a opção Six Initial Frequencies 6 Uma na janela Ouput irá se abrir automaticamente mostrando um novo gráfico de dispersão p vs t que agora inclui seis curvas cada uma representando a evolução de um dos seis loci com diferentes frequências iniciais 7 Selecione outras opções de plotagem observando os diferentes fatores plotados nos eixos das abcissas e das ordenadas 8 Na aba Input altere os seguintes parâmetros para executar novas simulações e diferentes plotagens selecionando View em seguida a Vantagem do Dominante WAA WAa Waa b Vantagem do Dominante com dominância incompleta WAA WAa Waa c Vantagem do Recessivo Waa WAA WAa d Vantagem do Heterozigoto com semelhança entre Homozigotos WAa WAA Waa e Vantagem do Heterozigoto com diferença entre Homozigotos WAa WAA Waa f Desvantagem do Heterozigoto com semelhança entre Homozigotos WAa WAA Waa g Desvantagem do Heterozigoto com diferença entre Homozigotos WAa WAA Waa 9 Na aba Input selecione a aba Selection e altere os parâmetros h e s a seu belprazer e execute suas próprias simulações selecionando em seguida View 10 Registre suas conclusões 11 Feche agora a janela Input e selecione a opção Model Natural Selection Selection and Mutation significando Modelo Seleção Natural Seleção e Mutação 12 Ao selecionar a opção acima aparecerá uma janela Input onde os seguintes parâmetros Parameters podem ser ajustados a s coeficiente de seleção b h grau de dominância do aleo A c µ taxa de mutação do alelo A para o alelo a d Generations o número de gerações a serem simuladas e Plot Type Tipo de Plotagem seleciona o tipo de gráfico a ser gerado após as simulações da mesma forma que apresentado acima Após iniciar o programa Populus httpscbsumnedupopolus selecione a opção Model Natural Selection Selection on a Diallelic Autosomal Locus significando Modelo Seleção Natural Seleção em um Loco Autosômico Dialélico 4 24 Na janela Input altere os valores de adaptabilidade W de cada genótipo de forma a simular os mesmos tipos de seleção simulados no item 8 e execute cada nova simulação ao menos dez vezes selecionando View alterando o tamanho da população N de forma que a N 10 b N 50 c N 500 máximo Não esqueça de registrar suas conclusões Seleção natural e interações Utilizando o programa Populus foi possível simular e analisar a seleção natural e interaçõesA seguir estão Figuras sobre a simulação da seleção natural obtida pelo programa Uma nova janela Output aparecerá mostrando um gráfico de dispersão p vs t Selection and Mutation q 74047E4 Autosomal Selection Selection and Mutation q 0001291 Selection and Mutation q 012247 Selection and Mutation q 070711 Drift and Selection Drift and Selection Deriva genética As Figuras a seguir correspondem a simulação de deriva genética obtida pelo Programa Populus Genetic Drift Monte Carlo Genetic Drift Monte Carlo Genetic Drift Monte Carlo Genetic Drift Monte Carlo Markov Model 3D Markov Model 3D Frequency Generation 3D Number of x genes per population Population Size Generations to Min to Frequency Frequency State Generation