Estrutura do DNA em Origami: Possibilidades Didáticas

3 ESTRUTURA DO DNA EM ORIGAMI POSSIBILIDADES DIDÁTICAS Lenira M N Sepel e Elgion L S Loreto Departamento de Biologia Universidade Federal de Santa Maria Autor para correspondência Departamento de Biologia Prédio 16 Campus Universidade Federal de Santa Maria CEP 97105900 Santa MariaRS BrasileMail elgionbaseufsmbr Palavraschave material didático modelos tridimensionais estrutura do DNA Resumo Apresentamos sugestões para o emprego didático de modelos tridimensionais da molécula de DNA feitos pela técnica do origami O grande potencial didático desses modelos reside no fato de apresentar uma atividade desa fiadora e envolvente requerendo materiais muito baratos Por meio do modelo os alunos podem visualizar e discutir as principais características da estrutura secundária da molécula de DNA como por exemplo a dupla hélice o antiparalelismo das fitas o emparelhamento das bases a cadeia açúcarfosfato hidrofílica localizada na fase externa da molécula a posição interna das bases entre outras Introdução A dupla hélice do DNA é provavelmente a estrutura molecular mais representada na atualidade tem sido utili zada como apelo para vendas em rótulos e em comerciais de vários produtos tem sido apresentada como ícone de ciência desenvolvimento e modernidade nos mais diver sos eventos na abertura dos jogos olímpicos em alegorias de desfiles de carnaval Assim como o emprego de modelos tridi mensionais foi fundamental no processo de descoberta da estrutura da molécula do DNA Watson 1987 a apresentação dessa estrutura sob forma de modelo nos diferentes níveis de ensino é um agente facilitador para a compreensão de vários fenômenos relacionados ao fun cionamento do DNA Algumas características da molécula de DNA são facilmente representadas em figuras e outras exigem esquemas mais elaborados e maior esforço de abstração Esperase que a apresentação de modelos tridimensionais facilite não só a compreensão da estrutura como também a posterior interpretação de figuras permitindo que o aluno reconheça com maior facilidade as situações relacionadas ao funcionamento celular que envolvem complementarie dade e antiparalelismo da fitas do DNA a existência dos sulcos e as possibilidades de mudanças nos parâmetros relacionados com a torção da molécula Os benefícios didáticos da apresentação de modelos são amplamente reconhecidos Existem para comercialização excelentes modelos da molécula de DNA construídos com diferentes materiais e com diferentes possibilidades de aplicação em salas de aula Porém os modelos comercializados na maioria das vezes são muito caros Como alternativa existem propostas para a construção de modelos didáticos da molécula de DNA empregando diversos materiais acessíveis p ex ver Loreto e Sepel 2003 Esses modelos contudo envolvem tempo para preparação e exigem do executor habilidades especiais o que também limita a aplicação Em 1995 Yen T propôs um modelo de DNA usando a milenar arte japonesa do Origami e o site wwwdnaiorg apresenta instruções simplificadas a partir dessa idéia Com a intenção de divulgar este material com fantástico potencial didático para professores de Biologia traduzimos e adaptamos as informações que estão no site As instruções de como fazer o origami foram detalhadas e uma série de fotos apresentando o processo passo a passo foi produzida para ver clique aqui arquivo origami de DNApdf Para tornar o modelo mais didático ainda in troduzimos algumas modificações no material original a identificação das bases nitrogenadas foi transferida para dentro da dupla hélice e o esqueleto fosfodiéster com a orientação antiparalela foi colocado nas laterais No presente trabalho propomos atividades didáti cas que podem facilitar o ensino da estrutura da molécula de DNA empregando o modelo de DNA em origami Acreditamos que esse material é extremamente promissor em sala de aula tendo como principais vantagens i ser um método ativo de aprendizagem capaz de envolver todos os participantes simultaneamente na mesma tarefa ii ser ex tremamente barato e de execução rápida permitindo que 0201 35 2007 wwwsbgorgbr ISSN 19803540 4 cada aluno possa fazer o seu próprio modelo iii permitir a visualização e discussão das principais características da molécula de DNA e também explorar alguns aspectos de funcionamento Utilização do Modelo em Sala de Aula As principais características da molécula de DNA que podem ser exploradas com esse modelo são 1 polímero formado por duas cadeias em dupla hélice com enrolamento para a direita 2 Esqueleto hidrofílico composto por desoxirribose e fosfato no exterior da molécula esqueleto açúcarfos fato 3 Bases nitrogenadas hidrofóbicas para o interior da molécula 4 Emparelhamentos específicos das bases em função do número de pontes de hidrogênio entre as bases Adenina sempre emparelha com Timina formando duas pontes de hidrogênio e Citosina sempre emparelha com Guanina com três pontes de hidrogênio 5 As fi tas são antiparalelas Enquanto uma fi ta está em sentido 5 3 a outra está no sentido 3 5 Sugerimos que o modelo em origami seja utilizado após a apresentação dessas características e que o aluno seja estimulado a reconhecer no modelo a organização polimérica identifi cando quais são os monômeros e re visando os diferentes açúcares e bases que podem fazer parte dos nucleotídeos Para que o modelo possa ser bem explorado o ideal é que o aluno tenha bem claro o signifi cado das representa ções composição do nucleotídeo e formação do esqueleto fosfodiéster para conseguir identifi car no modelo Figura 1 como e onde estarão representadas A B Figura 1 A representação esquemática de um nucleotídeo com o grupo fosfato o açúcar e a base nitrogenada B representação esquemática de uma fi ta do DNA formada pela união de vários nucleotídeos Primeira atividade Apresentação do modelo e revisão da estrutura de duplahélice e pareamento das bases Nessa fase inicial é importante destacar que dife rentes das representações bidimensionais em que as fi tas complementares do DNA são representadas com as bases emparelhadas de modo direto A em uma linha corres ponde a T na outra linha no modelo para dobradura os emparelhamentos aparecem em linhas diagonais a ade nina de uma fi ta tem seu par na outra fi ta em uma posição imediatamente acima ou abaixo em linha diagonal i Distribua aos alunos uma folha de papel impresso com o modelo descrito na fi gura para modelo clique aqui arquivo modPBpdf e auxilie os alunos a identifi car como a dupla fi ta está representada uma fi ta corresponde à coluna do modelo marcada pela seta vermelha e a outra fi ta corresponde à indicada pela seta azul Figura 2 ii É necessário explicar que para o modelo em origami e só em função das dobras que serão executadas a dupla fi ta é representada duas vezes a coluna sinalizada pela seta verde é uma imagem real invertida iii Para que o conceito de complementariedade das bases AT CG fi que evidente e seja associado ao número de pontes de hidrogênio que se estabelece entre as moléculas três entre G e C e duas entre A e T o aluno deve reconhecer que no modelo as pontes de hidrogênio são representadas através das linhas diagonais que unem as bases complementares iv Apenas algumas bases estão representadas pelas letras correspondentes no modelo A sugestão é que o alu no complete os pares usando as regras do emparelhamento e marcando também a presença das pontes de hidrogênio com linhas ligando as bases ver Figura 2 B Nessa etapa é possível revisar os conceitos relacionados com a complementariedade das fi tas e destacar a importância dessa característica para os processos de transmissão de informação na replicação e na transcrição Figura 2 A B Figura 2 Preenchimento das fi tas complementares no modelo de DNA Segunda atividade o dobramento do origami e a discussão da estrutura secundária da molécula e suas propriedade físicoquímicas Após o dobramento do origami o modelo fi cará como o apresentado na Figura 3 5 O dobramento em hélice da molécula tornase evi dente e também fica fácil observar a posição ocupada pelo esqueleto açúcarfosfato na parte externa da dupla hélice e a presença das bases nitrogenadas no interior Figura 3 Origami da molécula de DNA em que as principais características desta molécula podem ser identificadas Neste momento o professor pode trabalhar os aspectos físicoquímicos decorrentes da composição molécula do DNA por exemplo as características hidrofí licas do esqueleto fosfodiéster pela presença das pentoses e o caráter ácido conferido pelo grupo fosfato A discussão sobre as conseqüências das posições do esqueleto fosfodiéster e das bases na molécula também pode ser interessante A solubilidade do DNA associada à parte externa da molécula em contato com a água es queleto fosfodiéster e a neutralização das regiões eletri camente carregadas através de pareamentos entre as bases AT e CG permitindo que a região hidrofóbica sem cargas elétricas livres fique no interior da molécula Terceira atividade a orientação antiparalelas das fitas as formas DNAA e DNAB O esqueleto açúcar fosfato representado na lateral do modelo tem por objetivo destacar o antiparale lismo das fitas permitindo visualizar os sentidos 53 e 35 A observação dessa representação pode servir para discutir quais os elementos responsáveis pela orientação da fita o que é uma dúvida relativamente comum entre os alunos Outros elementos que podem ser explorados são o enrolamento para direita característico da forma DNAB e as diferentes estruturas secundárias do DNA formas A e Z Com uma segunda dobradura é possível produzir um modelo com enrolamento para a esquerda i Em uma nova folhamodelo faça as dobras do modo anteriormente descrito até o passo 5 ii No passo 6 ao invés de fazer as dobras em montanha no lado indicado pelo sinal faça as dobras do outro lado não marcado iii No passo 7 no lado do papel marcado pelo sinal dobre em vale nas linhas transversais e depois siga os mesmos passos indicados Com essas trocas no dobramento o modelo ficará com o enrolamento para a esquerda A comparação dos modelos com enrolamento para a direita e a esquerda Figura 4 fica mais fácil se os modelos forem coloridos Para obter os modelos coloridos clique aqui arquivo origamiDNApdf Figura 4 Modelo de origami com enrolamento para a direita e a esquerda respecti vamente No Ensino Superior pelo simples fato das infor mações básicas sobre a estrutura do DNA terem sido apresentadas no Ensino Médio há um grau maior de dificuldade em despertar a curiosidade e para prender a atenção em relação a esses temas Por ser uma aula em que os alunos são desafiados a interpretar e executar uma receita fazer as dobraduras do origami a quantidade e qualidade de questionamentos aumentam As idéias pré vias que o aluno traz nem sempre se ajustam ao modelo e o surgimento de dúvidas é espontâneo A adequação do modelo à estrutura apresentada nos livros detectando os defeitos do modelo os pontos onde ele não representa de modo fiel a estrutura do DNA e as sugestões de como melhorálo é um tema rico para discussão pois estimula os alunos a refletir e pesquisar sobre um dos temas mais corriqueiros dos programas de Genética A construção do modelo de DNA também pode criar a oportunidade para o aluno de graduação desenvolver simulações e outros modelos inovadores relacionados aos processos de fluxo de informação genética O mesmo conjunto de atividades pode ser desen volvido com o modelo de DNA em origami para turmas de Ensino Médio com as mesmas vantagens Neste caso a ênfase recai sobre os conceitos básicos relativos à com plementariedade e a atividade pode servir como reforço para os conteúdos apresentados em livros didáticos BIBLIOGRAFIA Loreto ELS e Sepel LMN Atividades Experimentais e Didáticas de Biologia Molecular e Celular São Paulo SBG 2003 2ed Watson JD A dupla hélice Lisboa Gradiva 1987 Yen T Make your own DNA Trends in Biochemical Sciences2094 1995